本发明公开了一种基于FSHR基因的猪繁殖性状相关的分子标记及其检测方法和应用。所述的分子标记为猪FSHR基因片段,所述的猪FSHR基因片段含有多态性位点,所述的多态性位点为如SEQ ID NO.1所示序列中第1166位,所述的多态性位点具有C/T碱基的变异。所述的检测方法,包括:根据所述的分子标记的核苷酸序列设计引物;以待检测猪的基因组DNA为模板进行PCR扩增;判断PCR扩增产物中多态性位点的类型。本发明还公开了所述的分子标记在猪繁殖性状选择中的应用。本发明根据FSHR基因突变位点提供了基于FSHR基因的猪繁殖性状相关的分子标记及其检测方法和应用,为猪分子育种、研究猪繁殖生理机制提供基础。