The system has a filling unit (1), a shredding unit (2), a mixing and metering unit (3), and a heating device comprising an inlet for waste. A microwave chamber (4) is arranged with a transport unit for routing of waste continuously along a microwave transmitter. A set of temperature maintaining units (10) maintaining temperature of hot waste comprises a conduit with a rectilinear curved section (11) laid out at an output of the microwave chamber, where the rectilinear section is followed by another curved section (12). The sections are made from metallic material.Système de décontamination de déchets comportant essentiellement et successivement :- des moyens de remplissage (1), de déchiquetage (2), de mélange et de dosage (3) - un dispositif de chauffage comprenant une entrée pour les déchets, au moins une chambre à micro-ondes (4) avec des moyens de transport pour lacheminement en continu des déchets le long dau moins un émetteur de micro-ondes, et une sortie pour les déchets chauds - des moyens de maintien en température (10) des déchets chauds,Selon linvention, lesdits moyens de maintien en température (10) des déchets chauds présentent un conduit comprenant un premier tronçon (11) rectiligne disposé à la sortie de ladite au moins une chambre à micro-ondes (4), auquel succède un deuxième tronçon courbé (12).