A system and method of identifying anatomical structures in a patient. The method includes the acts of acquiring an image of the patient, the image including a set of image elements segmenting the image to categorize each image elements according to its substance computing the probability that the categorization of each image element is correct resegmenting the image starting with image elements that have a high probability and progressing to image elements with lower probabilities aligning at least one of the image elements with an anatomical atlas and fitting the anatomical atlas to the segmented image.Linvention concerne un système et un procédé didentification de structures anatomiques chez un patient. Le procédé comprend les étapes consistant à acquérir une image du patient, limage comprenant un ensemble déléments dimage segmenter limage pour classer par catégorie chaque élément dimage selon sa substance calculer la probabilité selon laquelle le classement par catégorie de chaque élément dimage est correct resegmenter limage en commençant par les éléments dimage qui ont une probabilité élevée et en continuant avec les éléments dimage ayant des probabilités inférieures aligner au moins un des éléments dimage avec un atlas anatomique et adapter latlas anatomique à limage segmentée.