PURPOSE: A method for manufacturing cheese containing fermented soybeans is provided to improve spreadibility in heating, moisture, texture and sensory properties of the cheese by adding constant amounts of flavor enhancer after making the soybean cheeses containing soybean flour, and to offer beneficial effects of Flavourzyme. CONSTITUTION: A method for manufacturing cheese containing fermented soybeans comprises the following steps: fermenting soybean milk including soybean flour with proteolytic enzyme; manufacturing soybean cheese by agitating the fermented soybean milk; manufacturing the cheese containing the fermented soybeans by fermenting the soybean cheese; and adding flavor enhancer selected from a group consisting of cinnamomi cortex, garlic, zingiberis rhizoma crudus, green tea, and herb in the cheese. The proteolytic enzyme is Flavourzyme. The proteolytic enzyme is treated for 1 minute ~ 2 hours at a temperature of 30-70°;C. 본 발명은 다음의 단계를 포함하는 콩을 원료로 한 청국장 치즈의 제조방법을 제공한다: (a) 콩분말을 포함하는 두유(soybean milk)에 단백질 가수분해 효소를 첨가하여 효소 처리하는 단계; (b) 상기 단계 (a)에서 효소 처리된 두유를 교반하여 콩 치즈를 제조하는 단계; 및 (c) 상기 단계 (b)에서 제조한 콩 치즈를 청국장 발효하여 청국장 치즈를 제조하는 단계. 본 발명의 청국장치즈의 제조방법에서는 콩분말(soybean flour)이 포함된 두유를 단백질 가수분해효소로 처리하여 콩분말의 열응고성을 향상시켰다. 단백질 가수분해 효소로 처리된 두유로 제조된 청국장치즈는 가열시퍼짐성, 수분함량, 텍스쳐, 관능적 특성이 향상되어 우수한 품질을 나타낸다. 본 발명의 방법에 의해 제조된 청국장치즈는 기존의 치즈를 대체할 수 있는 재료로 개발될 가능성이 매우 크다.