The position detection system includes a capsule type endoscope which is a part of a resonance circuit and in which a marker coil for generating a magnetic field by flowing current is provided therein, and a detection signal is detected by detecting a magnetic field generated by the marker coil A reference coil disposed at a position where an SN ratio of a magnetic field generated by a marker coil to a magnetic field generated by a marker coil is smaller than an SN ratio of a detection signal detected by a plurality of sense coils A magnetic field detection value based on a plurality of detection signals respectively output from a plurality of sense coils is corrected using a magnetic field detection value based on a signal and the position of the capsule endoscope is calculated using the corrected magnetic field detection value .位置検出システムは、共振回路の一部をなし、電流が流れることにより磁界を発生するマーカコイルが内部に設けられたカプセル型内視鏡と、マーカコイルが発生する磁界を検出して検出信号を出力する複数のセンスコイルと、マーカコイルが発生する磁界に対するSN比が複数のセンスコイルにより検出された検出信号におけるSN比よりも小さい位置に配置された参照コイルと、参照コイルから出力された検出信号に基づく磁界検出値を用いて、複数のセンスコイルからそれぞれ出力された複数の検出信号に基づく磁界検出値を補正し、補正された磁界検出値を用いてカプセル型内視鏡の位置を算出する演算部とを備える。