There is provided a method for preparing a fermented vinegar having excellent antioxidative, antimicrobial activity, cell viability and estrogen-like activity. A method for preparing a fermented vinegar using the roots comprises the steps of preparing a roasted hot-water extract by adding distilled water to a roots powder; Adding yeast to the roots hydrothermal extract to produce a roots fermented alcohol fermentation liquid; And adding acetic acid to the fermented alcoholic fermentation broth to produce a fermented extract of Root Root Extract.항산화성, 항균활성, 세포 생존율, 에스트로겐 유사활성이 우수한 칡뿌리 발효식초의 제조방법이 제공된다. 이 칡뿌리를 이용한 발효식초의 제조방법은, 칡뿌리 분말에 증류수를 가수하여 칡뿌리 열수추출물을 준비하는 단계; 칡뿌리 열수추출물에 효모를 첨가하여 칡뿌리 알코올 발효액을 생성하는 단계; 및 칡뿌리 알코올 발효액에 초산균을 첨가하여 칡뿌리 발효추출물을 생성하는 단계를 포함한다.