Provided is an endoscope system that acquires information about a residual liquid and efficiently removes the residual liquid, and an operation method thereof. Based on image signals in a plurality of wavelength bands, the information processing apparatus calculates baseline information that is information on light scattering characteristics or light absorption characteristics of an observation target and does not depend on specific biological information. A baseline correction value for matching the baseline information with reference baseline information that is a basis for evaluating the baseline information is calculated. The remaining liquid information on the remaining liquid included in the observation target is calculated from the baseline correction value.残液に関する情報を取得して、残液の除去を効率的に行う内視鏡システム及びその作動方法を提供する。複数の波長帯域の画像信号に基づいて、観察対象の光散乱特性もしくは光吸収特性に関する情報であって、特定の生体情報に依存しないベースライン情報を算出する。ベースライン情報を評価する基準である基準ベースライン情報に、ベースライン情報を合わせるためのベースライン補正値を算出する。ベースライン補正値から観察対象に含まれる残液に関する残液情報を算出する。
