The present invention relates to a method for producing a natural edible antimicrobial agent for food addition through complex nanoparticles of wasabi extract and an edible antimicrobial agent thereof. Natural edible antimicrobial preparation method for food addition of the present invention is characterized in that the extract of horseradish with nanoparticles of lecithin. The present invention uses a homogenizer process, a microfluidizer process, and an ultrasonic dispersion process, and nanoparticles of horseradish water-soluble extracts using lecithin to be edible for food use. It is highly useful to back.본 발명은 고추냉이 추출물의 복합 나노 입자화를 통한 식품 첨가용 천연 식용 항균제의 제조방법 및 그 식용 항균제에 관한 것이다.본 발명의 식품 첨가용 천연 식용 항균제 제조방법은 레시틴으로 고추냉이의 추출물을 나노 입자화하는 것을 특징으로 한다.본 발명은 homogenizer 공정과 microfluidizer 공정 그리고 초음파 분산 공정을 이용하고, 고추냉이 수용성 추출물을 식용에 적합하도록 레시틴을 이용하여 나노 입자화 하는 방법으로서 비 가열 처리가 요구되는 모든 식품 및 식품 설비ㆍ기구, 공정 등에 활용 가치가 높다.