Media beds containing worms living in an oxygenated aqueous environment are provided for the remediation of water containing excreted and other oxidizable organic or chemical waste. The media beds may include cultivated plant life in addition to the cultivated worm population for the uptake of nitrates, as well as other nutrients rendered soluble through digestion of the worms to remediate water to levels sufficient to be safely returned to the environment; alternatively the water may be remediated to higher nitrate levels in the absence of plants so that the water can be used in subsequent fertilization operations outside the waste treatment system. The system further includes cultivated microbial populations that may be present in the media beds and/or in separate bioreactors within the system.L'invention concerne des lits de milieu contenant des vers vivants dans un environnement aqueux oxygéné pour la réhabilitation d'eau contenant des déchets excrétés et d'autres déchets organiques ou chimiques oxydables. Les lits de milieu peuvent comprendre des végétaux vivants cultivés en plus de la population de vers cultivés pour l'absorption de nitrates, ainsi que d'autres nutriments rendus solubles par la digestion des vers afin de réhabiliter l'eau à des niveaux suffisants pour la renvoyer en toute sécurité dans l'environnement ; en variante, l'eau peut être réhabilitée à des niveaux de nitrate plus élevés en l'absence de plantes de telle sorte que l'eau puisse être utilisée dans des opérations de fertilisation ultérieures à l'extérieur du système de traitement de déchets. Le système comprend en outre des populations microbiennes cultivées qui peuvent être présentes dans les lits de milieux et/ou dans des bioréacteurs séparés à l'intérieur du système.