Methods and compositions for populating the gastrointestinal tract of a subject are described. Methods include administering to a subject a therapeutic composition comprising a purified population of spore-forming bacteria produced by providing a fecal material and subjecting the material to a treatment step resulting in purification of spore- forming bacteria. Methods include administering an amount effective to engraft and/or augment in the gastrointestinal tract in order to treat or prevent a dysbiosis in the mammalian subject.L'invention concerne des méthodes et des compositions pour peupler le tractus gastro-intestinal d'un sujet. Les méthodes consistent à administrer au sujet une composition thérapeutique comprenant une population purifiée de bactéries formant des spores produites par utilisation de matière fécale et soumission de la matière à une étape de traitement ayant pour résultat la purification des bactéries formant des spores. Les méthodes consistent également à administrer une quantité efficace capable se greffer et/ou d'augmenter dans le tractus gastro-intestinal afin de traiter ou d'empêcher la dysbiose chez un sujet mammifère.