A medicine supply system including a cart supply line (48) on which a plurality of carts (8) are disposed and aligned; a first transport unit for transporting the plurality of carts (8) on the cart supply line (48); a tray discharge unit (2) for storing the trays (7) in the plurality of carts; a second transport unit for transporting the plurality of carts with the trays stored in the tray discharge unit; a cart discharge line (49) on which the plurality of carts transported by the second transport unit are aligned; a tray supply lifter (1) for supplying the trays; a tray transport line (3) for transporting the trays supplied by the tray supply lifter to the tray discharge unit; a medicine dispensing unit (4) for dispensing the medicine to the trays, and a control unit (10) for supplying the trays from the tray supplying lifter 1 based on prescription data, dispensing the medicine into the trays, transporting the trays to the tray discharge unit, and storing the trays into the carts.카트(8)가 정렬해서 배치되는 카트 공급 라인(48)과, 카트 공급 라인(48)의 카트(8)를 반송하는 제1반송 장치와, 카트(8)에 트레이(7)를 수납하는 트레이 배출 장치(2)와, 트레이 배출 장치(2)로 트레이(7)가 수납된 카트(8)를 반송하는 제2반송 장치와, 제2반송 장치에 의해 반송된 카트(8)가 정렬되는 카트 배출 라인(49)과, 트레이(7)를 공급하는 공급 리프터(1)와, 공급 리프터(1)에 의해 공급된 트레이(7)를 트레이 배출 장치(2)에 반송하는 트레이 반송 라인(3)과, 트레이 반송 라인(3)의 도중에 설치되어, 트레이(7)에 약품을 불출하는 약품 불출 장치(4)와, 처방 데이터에 근거하여, 공급 리프터(1)로부터 트레이(7)를 공급하고, 처방 데이터에 포함되는 약품을 공급 가능한 약품 불출 장치(4)로부터 약품을 트레이(7)에 불출하고, 트레이 배출 장치(2)에 반송하여, 카트(8)에 수납시키는 제어 장치(10)를 구비한다.