To create an accurate magnetic susceptibility map.SOLUTION: A medical image processing apparatus includes an image creation unit, and a magnetic susceptibility map creation unit. The image creation unit creates a relaxation time map of a tissue based on a plurality of intensity images corresponding to a plurality of echo times. The magnetic susceptibility map creation unit creates a magnetic susceptibility map indicating a plurality of magnetic susceptibilities in a subject quantitatively based on the magnetic field distribution created by a plurality of phase images corresponding to the plurality of echo times and the relaxation time map. The magnetic susceptibility map creation unit creates an edge mask by executing edge detection to the relaxation time map, and creates the magnetic susceptibility map by optimization processing accompanied by regularization term for smoothing the magnetic susceptibility in a non-edge region in the relaxation time map using the edge mask.SELECTED DRAWING: Figure 2【課題】高精度な磁化率マップを生成すること。【解決手段】医用画像処理装置は、画像生成部と、磁化率マップ生成部とを有する。画像生成部は、複数のエコー時間に対応する複数の強度画像に基づいて組織の緩和時間マップを生成する。磁化率マップ生成部は、複数のエコー時間に対応する複数の位相画像により生成された磁場分布と、緩和時間マップとに基づいて、被検体内の複数の磁化率を定量的に示す磁化率マップを生成する。磁化率マップ生成部は、緩和時間マップに対してエッジ検出を実行することにより、エッジマスクを生成し、エッジマスクを用いて緩和時間マップにおける非エッジ領域内の磁化率を平滑化させる正則化項を伴った最適化処理により、磁化率マップを生成する。【選択図】図2