The present invention provides a method for manufacturing a functional food containing Hongkuk rice (fermented red rice). The method comprises the steps of: mixing and agitating 30-50 parts by weight of Hongkuk flour and Hongkuk rice flour on a basis of 100 parts by weight of alcohol for 12 hours to manufacture a functional raw material composition obtained under a pressure of 80-120 Kg/cm^2 placing the rice in a rotating body so that the rice can absorb an extract and spraying and infiltrating the functional raw material on a surface and inside of the rice grains and a drying and preserving step of removing moisture exceeding the rice moisture content to remove residual water or alcohol.본 발명은 주정 100을 기준으로 홍국분말 및 홍국쌀가루 30 내지 50중량부를 12시간 교반하여 80 내지 120Kg/cm2의 압력조건하에서 홍국추출물을 획득하는 기능성원료 조성물을 제조단계 상기 추출물을 쌀에 흡수시키기 위하여 회전체에 쌀을 위치시키고 추출물을 분사하는 쌀 입자 표면 및 내부에 기능성 원료를 흡수시키는 단계 및 잔존 수분 내지 알코올 제거하기 위하여 쌀 수분율 이상의 수분을 제거하는 건조 및 보존단계를 포함하는 홍국쌀을 포함하는 기능성 제조방법을 제공한다.