Three-dimensional rendering of a two-dimensional organ image which is shaped through augmentation reality and conversion into an organ model of a temporary image enables the user to recognize the virtual image of reality, the degree of depth between the organ models of the virtual image and the organ of the virtual image A surgical navigation system operation method that makes it easier to perceive a depth relationship between a model and a surgical tool is provided. A method of operating a surgical navigation system according to the present invention includes the steps of identifying an object from a human body image captured by a camera, shaping a two-dimensional organ image for the object using augmented reality, Dimensional rendering to create an organ model of the temporary image.増強現実を通じて形状化される2次元臓器イメージを3次元レンダリングして仮像の臓器模型に変換することで、使用者が仮像現実で仮像の臓器模型間の深さ程度及び仮像の臓器模型と手術道具と間の深さ関係をより容易に認知できるようにする手術ナビゲーションシステム運用方法を提供する。本発明による手術ナビゲーションシステム運用方法は、カメラによって撮像される人体画像からオブジェクトを識別する段階と、増強現実を用いて、前記オブジェクトに対する2次元の臓器イメージを形状化する段階と、前記臓器イメージを3次元レンダリングして、仮像の臓器模型を作成する段階と、を含む。