本发明公开了一种小麦高分子量谷蛋白亚基及其编码基因与应用。本发明所提供的小麦高分子量谷蛋白亚基,它是具有序列表中SEQ ID №:2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №:2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质。小麦高分子量谷蛋白亚基的编码基因,是下列核苷酸序列之一:1)序列表中SEQ ID №:1的DNA序列;2)序列表中SEQID №:3的DNA序列;3)编码序列表中SEQ ID №:2蛋白质序列的多核苷酸;4)与序列表中SEQ ID №:1或SEQID №:3限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。本发明的小麦高分子量谷蛋白亚基的编码基因1By15将在谷类作物特别是小麦品质的转基因育种中得到广泛的应用。