The method for preparing a powdered chonggukjang containing a lotus root of the present invention is characterized in that 300-500 parts by weight of water-immersed soybean is removed from the water and 100-300 parts by weight of the lotus root is washed, A step of growing the soybean and rootstock; a step of preparing a first composition in which the fermented soybean and rootstock are firstly fermented and mixed; and a step of adding the bacillus subtilis to the first composition, A step of preparing a lotus root by fermenting the mixture through a hot-air drier at 50 to 60 ° C. for 50 to 60 minutes to have a moisture content of 7 to 8% Preparing a second composition by mixing onion powder and lotus root powder with crushed ground lotion chungkukjang powder, and mixing the powdered pregelatinized chrysanthemum powder with 1300 to 1600 weight Mixing the second composition and kneading the mixture to prepare a third composition; preparing a third composition as a granular chungkukjang through a granulator; and drying the granular chunggukjang to a moisture content of 7 ~ 8% through a hot air drier Powdering the dried third composition into chips, and preparing the powdered third composition through a stick-type packing machine into a powdery chungkukjang.본 발명의 연근이 함유된 분말형 청국장 제조방법은 수침한 대두 300~500중량부를 물기를 빼고, 연근 100~300중량부를 세척한 다음 물기를 뺀 다음 세절하는 공정으로 이루어진 대두와 연근의 전처리 단계와, 상기 대두와 연근을 증자시키는 단계와, 증자된 대두와 연근을 1차 발효시켜 혼합한 제1조성물을 제조단계와, 상기 제1조성물에 고초균을 첨가하고 광목천에 여러겹으로 싼 후 배양기를 통해 2차 발효시켜 연근 청국장을 제조하는 단계와, 상기 연근 청국장을 열풍건조기를 통해 50 내지 60℃에서 50분 내지 60분 동안 건조시켜 연근 청국장이 7~8%의 수분함유율을 갖도록 하는 단계와, 건조된 연근 청국장을 분쇄하는 단계와, 분쇄된 연근 청국장 분말에 양파가루, 연근가루를 혼합하여 제2조성물을 제조하는 단계와, 화분이 첨가된 꿀물 1300 내지 1600중량부에 상기 제2조성물을 혼합 후 반죽하여 제3조성물을 제조하는 단계와, 과립기를 통해 제3조성물을 알갱이 청국장으로 제조하는 단계와, 열풍건조기를 통해 알갱이 청국장을 수분함유량 7~8%으로 건조시키는 단계와, 건조된 제3조성물을 채에 걸러 분말화시키는 단계와, 분말화된 제3조성물을 스틱형포장기를 통해 분말형 청국장으로 제조하는 단계로 이루어진다.