A method of qualifying a mesenchymal stem cell (MSC) population is disclosed. The method comprises: (a) ex vivo differentiating a population of mesenchymal stem cells originating from the subject towards a first lineage-specific cell, the first lineage-specific cell being associated with a brain disease (b) ex vivo differentiating a population of mesenchymal stem cells originating from a healthy subject towards the first lineage-specific cell (c) comparing an effect of the first lineage specific cell derived from the subject with an effect of the first lineage specific cell derived from the healthy subject on a second lineage specific cell associated with the brain disease, wherein a difference in the effect above or below a predetermined level is indicative of a qualification of a mesenchymal stem cell population.Linvention concerne un procédé de qualification dune population de cellules souches mésenchymateuses (CSM). Ce procédé comprend les étapes suivantes consistant à : (a) réaliser une différenciation ex vivo dune population de cellules souches mésenchymateuses provenant du sujet vers une première cellule spécifique dune lignée, ladite première cellule spécifique dune lignée étant associée à une maladie du cerveau (b) réaliser une différenciation ex vivo dune population de cellules souches mésenchymateuses provenant dun sujet sain vers la première cellule spécifique dune lignée (c) comparer un effet de la première cellule spécifique dune lignée provenant du sujet à un effet de la première cellule spécifique dune lignée provenant du sujet sain sur une deuxième cellule spécifique dune lignée associée à la maladie du cerveau, une différence deffet au-dessus ou au-dessous dun niveau prédéfini indiquant une qualification dune population de cellules souches mésenchymateuses.