A method of qualifying a mesenchymal stem cell (MSC) population is disclosed. The method comprises: (a) ex vivo differentiating a population of mesenchymal stem cells originating from the subject towards a first lineage-specific cell, the first lineage-specific cell being associated with a brain disease; (b) ex vivo differentiating a population of mesenchymal stem cells originating from a healthy subject towards the first lineage-specific cell; (c) comparing an effect of the first lineage specific cell derived from the subject with an effect of the first lineage specific cell derived from the healthy subject on a second lineage specific cell associated with the brain disease, wherein a difference in the effect above or below a predetermined level is indicative of a qualification of a mesenchymal stem cell population.L'invention concerne un procédé de qualification d'une population de cellules souches mésenchymateuses (CSM). Ce procédé comprend les étapes suivantes consistant à : (a) réaliser une différenciation ex vivo d'une population de cellules souches mésenchymateuses provenant du sujet vers une première cellule spécifique d'une lignée, ladite première cellule spécifique d'une lignée étant associée à une maladie du cerveau ; (b) réaliser une différenciation ex vivo d'une population de cellules souches mésenchymateuses provenant d'un sujet sain vers la première cellule spécifique d'une lignée ; (c) comparer un effet de la première cellule spécifique d'une lignée provenant du sujet à un effet de la première cellule spécifique d'une lignée provenant du sujet sain sur une deuxième cellule spécifique d'une lignée associée à la maladie du cerveau, une différence d'effet au-dessus ou au-dessous d'un niveau prédéfini indiquant une qualification d'une population de cellules souches mésenchymateuses.