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基于16SrDNA深度测序检测不同大豆根际土壤原核微生物的方法
- 专利权人:
- 南京大学
- 发明人:
- 杨永华,陆桂华,戚金亮,杨荣武,庞延军,朱银玲,孔令如,汤程贻
- 申请号：
- CN201610089583.9
- 公开号：
- CN105525025A
- 申请日:
- 2016.02.17
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 胡锡瑜
- 摘要：
- 本发明属于土壤微生物学技术领域，具体涉及基于16SrDNA深度测序检测不同大豆根际土壤原核微生物的方法。该方法由以下步骤构成1.采集不同大豆在各发育时期的根系抖落土壤及根际土壤；2.从土壤中提取微生物宏基因组DNA；3.用双标签引物做PCR扩增上述DNA中16S rDNA第四高变区,以构建文库；4.对合格文库用Illumina Miseq平台做双末端250个核苷酸的边合成边测序，得到纯净READS；5.拼接，每样品产出至少3.8万条有效TAG用于聚类成可操作分类单元；6.物种组成、结构、多样性及相对丰度差异显著性分析；7.以根系抖落土壤作为系统对照，准确测定根际土壤原核微生物群落组成、结构、多样性、相对丰度，并比较不同大豆之间的异同。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
