The invention relates to a method for conditioning a biomass of microalgae of the genus Chlorella, preferably Chlorella protothecoides, produced by fermentation under heterotrophic conditions and in the absence of light for the preparation of a flour having an optimised sensory profile, the method being characterised in that it comprises the steps of: collection of the biomass directly at the end of the fermentation, and storage of same for less than 8 hours prior to conditioning HTST treatment of the thus recovered and stored biomass for between 30 seconds and 1 min 30, at a temperature below 70 °C and washing of the biomass with at most 3 volumes of water per volume of biomass.La invención se refiere a un método para acondicionar una biomasa de microalgas del género Chlorella, preferiblemente Chlorella protothecoides, producida mediante fermentación en condiciones heterotróficas y en ausencia de luz para la preparación de una harina que tiene un perfil sensorial optimizado, siendo el método caracterizado por que comprende los siguientes pasos: recolección de la biomasa directamente al final de la fermentación y almacenamiento de la misma durante menos de 8 horas antes del acondicionamiento tratamiento HTST de la biomasa recuperada y almacenada de este modo durante entre 30 segundos y 1 min 30, a una temperatura por debajo de 70°C, y lavado de la biomasa con a lo sumo 3 volúmenes de agua por volumen de biomasa.