본 발명은 다단식 묘삼 자동 운송 시스템에 관한 것으로서, 복수의 재배함을 다단으로 적재시킬 수 있는 적재 프레임과, 상기 각각의 재배함을 독립적으로 수평 왕복 이송시킬 수 있는 제1이송부와, 상기 제1이송부를 연동시켜 상기 재배함을 상기 적재 프레임으로부터 빼내거나 상기 제1이송부로 원위치시키는 제2이송부와, 상기 제2이송부를 승강시켜 상기 제1이송부와 제2이송부가 연결 또는 분리되도록 하는 승강부, 및 상기 제2이송부와 승강부를 수평 이동시켜 상기 제2이송부에 적재되는 상기 재배함을 외부로 반출 또는 반입시키는 메인 운송부로 구성됨으로써, 고중량의 재배함을 적재 프레임으로부터 자동으로 또한 독립적으로 빼내거나 원위치시킬 수 있게 함으로써, 안전사고를 미연에 방지하고, 작업의 효율성과 신속성 향상은 물론 생산 비용을 절감할 수 있
