本发明公开了一种抗羊包虫病感染的基因工程亚单位疫苗的制备方法，包括以下步骤：S1：从NCBI搜索并下载细粒棘球绦虫的EG95基因序列如SEQ ID NO.2所示，EG95氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示，然后进行氨基酸序列修饰，得到修饰后的EG95氨基酸序列；S2：将多个修饰后的EG95氨基酸序列的基因序列通过柔性linker进行串联表达，形成重组后的多EG95基因序列；S3：将重组后的多EG95基因序列克隆到pET28b质粒载体中，再转化到大肠杆菌BL21(DE3)中，采用添加标签的融合表达方式进行诱导表达得到重组蛋白；S4：将重组蛋白进行蛋白纯化后即得抗羊包虫病感染的基因工程亚单位疫苗原液。本发明可以大幅度降低羊包虫抗原的生产成本，大大简化了生产工艺，具有安全、高效、成本低等诸多优点。
