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藏羚羊血红素氧合酶-1基因编码区的克隆及序列分析

作   者:
曹学锋杨应忠马兰马燕格日力
作者机构:
青海大学医学院高原医学研究中心
关键词:
cDNA克隆序列分析藏羚羊血红素氧合酶-1低氧适应
期刊名称:
中国病理生理杂志
基金项目:
EPAS1基因多态性与高原肺水肿相关性研究
i s s n:
1000-4718
年卷期:
2012 年 28 卷 08 期
页   码:
1461-1465
摘   要:
目的:克隆藏羚羊血红素氧合酶-1基因编码区,并进行序列分析。方法:从藏羚羊肝组织中提取总RNA,利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术扩增出血红素氧合酶-1(HO-1)基因编码区cDNA片段,与载体连接构建重组质粒,经转化、扩增培养、鉴定后测序,测序结果利用生物信息学的方法进行分析。结果:藏羚羊HO-1基因编码区长度为897,编码298个氨基酸(GenBank登录号为:JQ809687);序列分析表明,藏羚羊HO-1基因的编码区序列与脊椎动物山羊和牛的相似性分别达到98%和96%,氨基酸序列相似性分别达到92%和97%,与其它脊椎动物HO-1基因的核苷酸及氨基酸序列相似性达到86%和87%以上,显示出高度保守性。构建的基于氨基酸序列的分子系统进化树聚类结果表明,藏羚羊与山羊的进化距离最近。结论:本研究成功地克隆出藏羚羊HO-1基因编码区序列,为从低氧细胞保护角度探讨青藏高原土著物种适应高原的分子生物学机制研究提供实验依据。
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