And provides a neutron capture therapy system capable of increasing the overall operation efficiency of the system. An irradiation chamber 30A and 30B capable of placing the patient S in the room and a charged particle beam P irradiated from the accelerator 11 are irradiated to the neutron beam P, The neutron beam output sections 12A and 12B for generating the neutron beam output N from the neutron beam output sections 12A and 12B by switching the traveling direction of the charged particle beam P and selectively outputting the charged particle beam P to the neutron beam output sections 12A and 12B A preparation chamber 50A and 50B juxtaposed to each of the irradiation chambers 30A and 30B and a treatment table 50B configured to be movable between the irradiation chambers 30A and 30B and the preparation chambers 50A and 50B, 80, and a management chamber 70 adjacent to both of the preparation chambers 50A, 50B. The management room 70 controls the beam transport path 13 to irradiate the charged particle beam P to the neutron beam output portions 12A and 12B corresponding to the irradiation chambers 30A and 30B in which the patient S is disposed And a control device 71.시스템 전체의 가동 효율을 높일 수 있는 중성자 포착요법 시스템을 제공한다. 하전입자선(P)을 출사하는 가속기(11)와, 환자(S)를 실내에 배치 가능한 조사실(30A, 30B)과, 가속기(11)로부터의 하전입자선(P)이 조사되어, 중성자선(N)을 생성하는 중성자선 출력부(12A, 12B)와, 하전입자선(P)의 진행 방향을 전환하여 하전입자선(P)을 중성자선 출력부(12A, 12B)에 선택적으로 출사하는 빔수송로(13)와, 조사실(30A, 30B)의 각각에 병설된 준비실(50A, 50B)과, 조사실(30A, 30B)과 준비실(50A, 50B)의 사이에서 이동 가능하게 구성된 치료대(80)와, 준비실(50A, 50B)의 모두에 인접한 관리실(70)을 구비한다. 관리실(70)은, 환자(S)가 배치된 조사실(30A, 30B)에 대응하는 중성자선 출력부(12A, 12B)에 하전입자선(P)을 조사하도록 빔수송로(13)를 제어하는 제어장치(71)를 가진다.