PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a medical information processing system and a medical information processing apparatus capable of accurately predicting a result of pathological examination based on a medical image.SOLUTION: The medical information processing system according to embodiments includes a first acquisition part, a second acquisition part, and an associating part. The first acquisition part identifies the position of a tissue from first medical image data being an image of a target site acquired before the tissue in the target site is collected and obtains an image feature value of the tissue. The second acquisition part obtains a result of a pathological examination performed on the tissue. The associating part associates the image feature value of the tissue with the result of the pathological examination.SELECTED DRAWING: Figure 1COPYRIGHT: (C)2019,JPO&INPIT【課題】医用画像を基づく病理検査の検査結果の予測を精度よく実施させることができる医用情報処理システム及び医用情報処理装置を提供すること。【解決手段】実施形態に係る医用情報処理システムは、第1の取得部と、第2の取得部と、関連付部とを備える。第1の取得部は、対象部位における組織が採取される前の前記対象部位の画像である第1の医用画像データから組織の位置を特定し、組織の画像特徴量を取得する。第2の取得部は、組織に対する病理検査の検査結果を取得する。関連付部は、組織の画像特徴量と病理検査の検査結果とを関連付ける。【選択図】図1