To provide methods of making engineered polypeptide conjugates (antibody-drug conjugates) comprising a specific acyl donor glutamine-containing tag and an amine donor substance and use methods thereof.SOLUTION: The invention provides an engineered polypeptide conjugate comprising Formula: polypeptide-T-A (T is an acyl donor glutamine-containing tag engineered at a specific site, A is an amine donor agent), where the amine donor agent is site-specifically conjugated to the acyl donor glutamine-containing tag at a carboxyl terminus, an amino terminus, or at an another site in the polypeptide, the acyl donor glutamine-containing tag comprises a specific sequence, and the engineered polypeptide conjugate comprises a specific amino acid substitution.SELECTED DRAWING: Figure 6【課題】特異的アシルドナーグルタミン含有タグと、アミンドナー物質を含む、操作されたポリペプチドコンジュゲート(抗体-薬剤コンジュゲート)の作製方法、及び使用方法の提供。【解決手段】式:抗体-T-A[式中、Tは、特異的部位で操作されたアシルドナーグルタミン含有タグ、Aはアミンドナー物質]を含む、操作されたポリペプチドコンジュゲート。前記アミンドナー物質は、抗体のカルボキシル末端、アミノ末端、または別の部位でアシルドナーグルタミン含有タグに部位特異的にコンジュゲートしており、前記アシルドナーグルタミン含有タグは特定の配列を含む、特定のアミノ酸置換を含む操作されたポリペプチドコンジュゲート。【選択図】図6