Magnetic nanoparticles are provided that have a superparamagnetic core and a nanoporous silica shell surrounding the core. The shell is functionalized with amine or S- nitrosothiol groups both inside and outside the nanopores. A process to provide such nanoparticles involves hydrolyzing tetraethoxysilane (TEOS) in a microemulsion of a superparamagnetic nanoparticle to form a superparamagnetic nanoparticle encapsulated by an incompletely hydrolyzed nanoporous silica shell, and hydrolyzing an amine- containing compound or a thiol-containing compound in situ in the presence of the incompletely hydrolyzed nanoporous silica shell before hydrolysis and densification of the silica shell is complete to functionalize the nanoporous silica shell with amine or thiol groups both inside and outside the nanopores and to maintain nanoporosity of the shell. Such magnetic nanoparticles are useful as carriers for chemical or biological species, particularly for magnetic resonance imaging, optical imaging, targeted drug delivery, cell delivery and magnetic separation applications.La présente invention concerne des nanoparticules magnétiques qui présentent un cœur superparamagnétique et une enveloppe en silice nanoporeuse entourant le cœur. Lenveloppe est fonctionnalisée avec des groupes amine ou S- nitrosothiol à la fois à lintérieur et à lextérieur des nanopores. Le procédé donnant lesdites nanoparticules implique lhydrolyse de tétraéthoxysilane (TEOS) dans une microémulsion dune nanoparticule superparamagnétique pour former une nanoparticule superparamagnétique encapsulée par une enveloppe en silice nanoporeuse incomplètement hydrolysée, et lhydrolyse dun composé contenant une amine ou dun composé contenant un thiol in situ en présence de lenveloppe en silice nanoporeuse incomplètement hydrolysée avant la fin de lhydrolyse et de la densification de lenveloppe en silice pour fonctionnaliser lenveloppe en silice nanoporeuse avec les groupes amine ou thiol à la fois à lintérieur et à l