本发明涉及一种地鳖虫抗血栓酶Eupolytin1及其基因和应用,属于生物医学领域。本发明从地鳖虫消化道中肠中分离纯化得到天然的抗血栓酶Eupolytin1,克隆出其编码基因,并利用大肠杆菌表达体系获得了与天然蛋白活性相当的基因工程产物。本发明的地鳖虫抗血栓酶Eupolytin1前体由254个氨基酸组成,其中1-28位氨基酸为信号肽部分,第29-254位氨基酸为成熟的Eupolytin1蛋白,该前体氨基酸序列一级结构为SEQ ID NO:1所示。本发明的抗血栓酶Eupolytin1的编码基因由888个核苷酸序列组成,其中第85-765位核苷酸编码成熟的Eupolytin1蛋白,该基因核苷酸序列为GenBank accession Gu187070。本发明的天然来源和重组表达的地鳖虫抗血Eupolytin1,经动物实验表明,能作为制备治疗血栓性疾病药物的应用。