本发明涉及一种牛虻抗血栓酶tablysin及其基因和应用,属于生物医学领域。本发明利用生物化学方法分离到天然的抗血栓酶,并扩增到其编码基因,并利用大肠杆菌表达体系获得了与天然蛋白活性相当的基因工程产物。本发明的牛虻蛋白酶tablysin,是从牛虻唾液腺中分离得到的一种活性蛋白质,分子量27KDa,其氨基酸序列为SEQ ID NO:1所示。本发明的牛虻蛋白酶tablysin基因由SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列组成。本发明的牛虻蛋白酶tablysin能水解纤维蛋白原和抑制血小板聚集,能抑制抑制角叉菜胶诱导的鼠尾静脉血栓形成,且无出血活性,能作为制备治疗血栓性疾病药物的应用。