本发明公开了一种水稻OsFLZ18基因在调控禾本科植物抗淹水胁迫中的应用,所述水稻OsFLZ18基因的核酸序列如SEQID NO.1所示,或为与SEQ ID NO.1完全互补配对的序列,或为编码氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的序列。通过基因克隆和生物学功能验证研究发现,上述OsFLZ18基因具有负向调控植物抗淹水胁迫的功能,对于植物有效抗淹水胁迫的分子机制研究具有重要的参考意义,可广泛应用于提高生物体有效抗淹水胁迫的能力,还可应用于水稻的基因遗传工程育种,通过改良水稻品种,提高水稻的耐淹抗性从而保障水稻产量的提高以及直播稻的推广应用。