A system for guided harvesting of mushrooms includes at least one shelving unit having a plurality of shelves, a plurality of mobile equipment carts movably mounted on the plurality of shelves and one or more computer processors. The carts are equipped with image data acquisition subsystems to acquire growing data of the mushrooms and non-invasive mushroom tagging subsystems to permit tagging of harvestable mushrooms. The one or more computer processors are programmed to identify the harvestable mushrooms from a synthesis of the growing data acquired by the image data acquisition subsystems on the plurality of carts and to operate the tagging subsystems to tag the harvestable mushrooms based on the harvestable mushrooms so identified.L'invention concerne un système de récolte guidée de champignons qui comprend au moins une unité de rayonnage comportant une pluralité d'étagères, une pluralité de chariots d'équipement mobile montés de façon mobile sur la pluralité des étagères, et un ou plusieurs processeur(s) informatique(s). Les chariots sont équipés de sous-systèmes d'acquisition de données d'image destinés à acquérir des données de croissance des champignons, et de sous-systèmes de marquage non invasif de champignons destinés à marquer les champignons pouvant être récoltés. Le(s) processeur(s) informatique(s) est/sont programmé(s) pour identifier les champignons pouvant être récoltés à partir d'une synthèse des données de croissance acquises par les sous-systèmes d'acquisition de données d'image sur la pluralité des chariots, et pour actionner les sous-systèmes de marquage afin de marquer les champignons pouvant être récoltés sur la base des champignons ainsi identifiés.