Provided is a method for processing low-fat coffee beans. The method for processing low-fat coffee beans according to one embodiment of the present invention comprises the following steps: steaming coffee beans to primarily decrease fatty acids contained in the coffee beans drying the steamed coffee beans to have a predetermined moisture content or less and treating the dried coffee beans at high temperature and high pressure to secondarily decrease the fatty acids.COPYRIGHT KIPO 2016저지방 커피 생두 가공 방법이 제공된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 저지방 커피 생두 가공 방법은, 커피생두를 증숙하여 상기 커피생두에 포함된 지방산을 1차감소시키는 단계, 증숙된 상기 커피생두를 소정 함수율 이하로 건조시키는 단계 및 건조된 상기 커피생두를 고온고압처리하여 상기 지방산을 2차감소시키는 단계를 포함한다.