The present invention relates to a radiation dose control method and system for medical linear accelerators, and more particularly, to a radiation dose control method and system for a linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy (IMRT) equipped with a magnetron oscillator will be. According to the embodiment of the present invention, it is possible to implement a linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy (IMRT) equipped with a magnetron oscillator capable of stably adjusting the output radiation dose. In addition, the linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy according to the embodiment of the present invention can be miniaturized as compared with a system using a conventional Kristron by using a magnetron as a high-frequency oscillator, and is also effective in cost.본 발명은 의료용 선형가속기의 방사선량 제어 방법 및 그 시스템에 관한 것으로서, 구체적으로는 마그네트론(magnetron) 발진기가 구비된 세기 조절 방사선 치료(IMRT)용 선형가속기의 출력 방사선량 제어 방법 및 그 시스템에 관한 것이다.본 발명의 실시예에 따르면, 출력 방사선량을 안정적으로 조절할 수 있는 마그네트론 발진기가 구비된 세기 조절 방사선 치료(IMRT)용 선형가속기의 구현이 가능하다.또한, 본 발명 실시예에 따른 세기 조절 방사선 치료용 선형가속기는 고주파 발진기로 마그네트론을 이용함으로써 종래 클라이스트론을 이용하는 방식에 비해 소형화할 수 있음은 물론 그 비용 면에 있어서도 효과적이다.