The present invention relates to a method and a system to control a medical linear accelerator radiation dose and, more specifically, to a method to control the dose output of a linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy (IMRT) with a magnetron oscillator and a system thereof. According to an embodiment of the present invention, a linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy capable of stably adjusting radiation output dose can be realized. Moreover, the linear accelerator for intensity-modulated radiation therapy in accordance to one embodiment of the present invention reduces its size, and is cost-effective using a magnetron as a high frequency oscillator when compared with a method using an existing klystron.본 발명은 의료용 선형가속기의 방사선량 제어 방법 및 그 시스템에 관한 것으로서, 구체적으로는 마그네트론(magnetron) 발진기가 구비된 세기 조절 방사선 치료(IMRT)용 선형가속기의 출력 방사선량 제어 방법 및 그 시스템에 관한 것이다.본 발명의 실시예에 따르면, 출력 방사선량을 안정적으로 조절할 수 있는 마그네트론 발진기가 구비된 세기 조절 방사선 치료(IMRT)용 선형가속기의 구현이 가능하다.또한, 본 발명 실시예에 따른 세기 조절 방사선 치료용 선형가속기는 고주파 발진기로 마그네트론을 이용함으로써 종래 클라이스트론을 이용하는 방식에 비해 소형화할 수 있음은 물론 그 비용 면에 있어서도 효과적이다.