An image processing apparatus, an image processing system, and an image processing program capable of extracting an abnormal part from a medical image are provided. An image processing apparatus includes an auto-encoder configured to restore and output a medical image having no abnormality with respect to an input medical image, and an abnormality with respect to the input medical image. The difference between the variance estimator configured to output the variance of the non-image, the image input accepting means for accepting the input of the medical image of the person to be diagnosed, the input image, and the restored image output by the auto encoder Difference map generating means for calculating and generating a difference map, standard deviation calculating means for calculating a standard deviation based on the estimated variance output from the variance estimator, and an input image and restoration based on the difference map and the standard deviation A diagnostic result image generating unit configured to extract a different part of the image and generate a diagnostic result image in which a different part other than the characteristic different part included in the input image is reduced； [Selection] Figure 8【課題】医療用画像から異常部位を抽出することができる画像処理装置、画像処理システム及び画像処理プログラムを提供する。【解決手段】画像処理装置は、入力された医療用画像に対して異常がない医療用画像を復元して出力するように構成されたオートエンコーダと、入力された医療用画像に対して異常がない画像の分散を出力するように構成された分散推定器と、診断対象者の医療用画像の入力を受け付ける画像入力受付手段と、入力画像と、オートエンコーダにより出力された復元画像との差分を算出して差分マップを生成する差分マップ生成手段と、分散推定器から出力された推定分散に基づいて標準偏差を算出する標準偏差算出手段と、差分マップと標準偏差に基づいて、入力画像と復元画像の差異部分を抽出するとともに、入力画像に含まれる特徴的な差異部分以外の差異部分を低減させた診断結果画像を生成する診断結果画像生成手段とを備える。【選択図】図８
