本发明公开了一种花器官特异表达的中山杉启动子ProThADH1及其应用,属于植物基因工程技术领域。本发明通过Genome Walking技术克隆了中山杉ThADH1基因的1717bp启动子序列,如SEQ ID NO.1所示,并采用通路克隆技术构建其Pcambia1301表达载体,进一步进行拟南芥遗传转化,通过GUS染色后,发现中山杉启动子ProThADH1具有启动子活性,且在拟南芥的花药,雄蕊,柱头中特异性的表达。因此,应用本发明提供的启动子,可以在植物基因工程中,诱导相应目的基因在植物花器官中特异表达,改良优良品种选育进程。