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一种奶山羊产羔性状相关基因单核苷酸多态性的检测方法
- 专利权人:
- 青岛农业大学
- 发明人:
- 沈伟,张瑞乾,赖方秾,李兰,闵令江,赵勇
- 申请号：
- CN201710130614.5
- 公开号：
- CN107217091A
- 申请日:
- 2017.03.07
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2017
- 代理人:
- 李静
- 摘要：
- 本发明涉及高通量测序、基因组学和生物信息学技术等领域，具体而言是以奶山羊单核苷酸多态性为基础，采用选择性消除分析的方法来分析与奶山羊产羔性状相关联的单核苷酸多态性以及候选基因的检测方法。包括如下步骤：1)将通过高通量测序的数据比对到参考基因组，然后使用免费的ANNOVAR软件注释奶山羊上的SNP位点。2)使用遗传分化系数(Fst)和杂合性分数(Hp)来评价两个产羔性能不同的群体测序序列，从而筛选出每一个滑动窗口中的SNPs。3)在低产群体和高产群体中筛选出纯合的SNPs，鉴定两个群体中特有的单碱基无义替换和非同义替换，因为这两种变异将通过直接影响蛋白质的翻译和氨基酸序列从而可能影响蛋白质结构和功能。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
