本发明公开了一个梨苹果酸转运蛋白基因PbrTDT1及其应用,属于植物基因工程技术领域。本发明从‘砀山酥梨’果实中克隆得到一个新的苹果酸转运蛋白基因PbrTDT1,其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示,其编码的氨基酸序列如序列表中SEQ ID NO:2所示。通过农杆菌介导遗传转化将该基因转化番茄,获得转基因植株,经生物学功能验证,转基因番茄果实中苹果酸的含量明显增加,表明本发明克隆的PbrTDT1基因具有调控果实果肉苹果酸含量的功能。本发明所述的梨TDT转运蛋白基因PbrTDT1可在果实酸度性状改良或构建高酸转基因果实中应用,并为提升植物果实品质的分子育种提供新的基因资源。