Methods and compositions are provided to identify and / or select soybeans or soybeans plants that are more resistant to nematodes in soybean sacs. In some cases, the method includes detecting at least one marker point related to the nematode resistance of other soybean cysts, and the method also includes at least one marker or haplotipo feature related to the nematode resistance of soybean cysts. About other ways,The method involves passing a second layer of soybeans through a selected soybean plant. In addition, markers, promoters, probes and kits are provided to identify and / or select soybean or soybean sprout plants that are more resistant to nematodes in soybean sacs.Se proporciona diversos métodos y composiciones para identificar y/o seleccionar plantas de frijol de soja o germoplasma de frijol de soja con resistencia mejorada al nematodo del quiste del frijol de soja. En ciertas modalidades, el método comprende detectar por lo menos un locus marcador que se asocia con la resistencia al nematodo del quiste del frijol de soja En otras modalidades, el método comprende, además, detectar por lo menos un perfil de marcadores o haplotipo asociado con la resistencia al nematodo del quiste del frijol de soja. En modalidades adicionales, el método comprende cruzar una planta de frijol de soja seleccionada con una segunda planta de frijol de soja. Se proporciona, además, marcadores, iniciadores, sondas y kits útiles para identificar y/o seleccionar plantas de frijol de soja o germoplasma de frijol de soja con resistencia mejorada al nematodo del quiste del frijol de soja.