Provided herein are methods, kits and devices for detecting ischemic stroke and identifying biomarkers of ischemic stroke. By assessing the expression pattern of ischemic stroke biomarkers in a biological sample, it may be possible to diagnose stroke in a time sensitive, bedside manner. The present invention provides, for example, a. Measuring the level of cell-free nucleic acid in a sample from a subject; b. Comparing said level of cell-free nucleic acid to a reference level of cell-free nucleic acid in a reference sample, wherein said reference sample is from a pseudo-stroke subject; and c. Determining whether the sample or the reference sample has a higher level of cell-free nucleic acid is provided.本明細書で、虚血性脳卒中を検出し、虚血性脳卒中のバイオマーカーを識別するための方法、キットおよびデバイスが提供される。生体試料中の虚血性脳卒中バイオマーカーの発現パターンを評価することにより、時間に敏感な、ベッドサイドの方法での脳卒中の診断が可能になり得る。本発明は、例えば、a.対象からの試料中の無細胞核酸のレベルを測定するステップ;b.無細胞核酸の前記レベルを参照試料中の無細胞核酸の参照レベルと比較するステップであって、前記参照試料は疑似脳卒中対象からのものであるステップ;およびc.前記試料または前記参照試料が無細胞核酸のより高いレベルを有するかを決定するステップを含む、方法を提供する。