An imaging system includes an optical probe to generate imaging data, a tracking system to track the optical probe, a light source operatively coupled to the optical probe, and a processing device communicably coupled to the tracker. The light source enables optical sectioning by the imaging system. The processing device applies optical sectioning to generate a first image based on a subset of the imaging data. The processing device further determines first position data and first orientation data associated with the optical probe as the subset of the imaging data was generated and applies a geometric transformation to the first position data and the first orientation data to determine a first position in a virtual three dimensional space. Furthermore, the processing device generates a three dimensional model comprising the first image placed at the first position in the virtual three dimensional space.Linvention concerne un système dimagerie comprenant une sonde optique pour générer des données dimagerie, un système de suivi pour suivre la sonde optique, une source de lumière couplée fonctionnellement à la sonde optique, et un dispositif de traitement couplé en communication avec le dispositif de suivi. La source de lumière permet un sectionnement optique par le système dimagerie. Le dispositif de traitement applique un sectionnement optique afin de générer une première image sur la base dun sous-ensemble des données dimagerie. Le dispositif de traitement détermine en outre des premières données de position et des premières données dorientation associées à la sonde optique pendant que le sous-ensemble des données dimagerie est généré et applique une transformation géométrique aux premières données de position et aux premières données dorientation pour déterminer une première position dans un espace tridimensionnel virtuel. En outre, le dispositif de traitement génère un modèle tridimensionnel comprenant la première image placée à la première position dans lespace t
