本发明属于作物分子育种技术领域。具体涉及一种油菜隐性核不育恢复基因BnaC.Tic40的分离克隆、功能验证和应用。本发明分离的甘蓝型油菜隐性核不育恢复基因BnaC.Tic40,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,它编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。分离的甘蓝型油菜隐性雄性不育基因BnaA.Tic40-1,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明还公开了所述的基因在甘蓝型油菜细胞核雄性不育遗传改良中的应用。利用分子标记技术定位和克隆恢复基因BnaC.Tic40,可以加快油菜等作物隐性细胞核雄性不育系和临保系的选育,从而在繁殖制种时获得100%不育的群体,突破核不育系在油菜等作物杂种优势利用中的瓶颈。