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小麦BSR‑Seq基因定位的方法
- 专利权人:
- 北京麦美瑞生物科技有限公司
- 发明人:
- 谢菁忠,刘志勇,吴秋红
- 申请号:
- CN201610551811.X
- 公开号:
- CN106202995A
- 申请日:
- 2016.07.13
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 郑立明`赵镇勇
- 摘要:
- 本发明公开了一种小麦BSR‑Seq基因定位的方法,包括混池的构建和测序、质量变异挖掘、与目的基因紧密连锁的转录本的筛选、分子标记开发和定位等步骤。将下一代转录组测序技术(转录组测序,RNA‑Seq)和混池技术(Bulked Segregant Analysis,BSA)相结合,首先利用小麦测序草图序列作为参考序列;其次采用下一代测序技术高通量挖掘转录本上的大量的高质量SNP遗传变异,再结合混池技术精确计算等位基因频率来快速的筛选出可能与目的性状紧密连锁的转录本,并通过Fish精确检验控制假阳性。不依赖于参考基因组序列、低成本、快速、精度高,提升了小麦基因定位的效率和精度并降低了小麦多态性分子标记开发的成本,使小麦基因的精细定位工作时长从数年降低到数月、定位精度从数cM降低到零点几或0cM以及精细定位成本从数万降低到数千。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/