本发明涉及一种橡胶树花器官特征因子基因HbPMADS2,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1,一种橡胶树花器官特征因子基因HbPMADS2编码的蛋白质,氨基酸序列如SEQ ID NO:2,本发明还涉及橡胶树花器官特征因子基因HbPMADS2的应用。本发明的基因HbPMADS2为一类转录基因,参与橡胶树花芽分化、以及雌雄蕊的发育进程,在植物生长发育和信号转导中起着重要的、不可或缺的作用,该基因对橡胶树的叶片和根系发育、以及果实发育中起着重要的调控作用,可利用HbPMADS2基因对橡胶树进行遗传改良,为促进橡胶树根系发育,以及提高橡胶树座果率提供有效的基因资源。