Apparatus and assemblies for automated sterile collection of urine and other biomaterials for medical testing, law enforcement testing, etc. Individual sample collection cartridges include an inflatable collection conduit and an inflatable collection vessel. The collection vessel can be sealed in multiple locations in a chronologically sequential manner to segregate an initial or “dirty” portion of a urine stream.L'invention concerne un appareil et des ensembles de collecte stérile automatisée d'urine et d'autres biomatériaux dans le cadre d'un test médical, d'un test demandé par les forces de l'ordre, etc. Des cartouches de collecte d'échantillons individuels comportent un conduit de collecte gonflable et un récipient de collecte gonflable. Le récipient de collecte peut être scellé en de multiples emplacements d'une manière chronologiquement séquentielle afin de séparer une partie initiale ou « souillée » d'un flux d'urine.