The present invention (a) as a core lactic acid bacteria; (b) a first shell layer surrounding the core and comprising natural polysaccharides; (c) a second shell layer surrounding the first shell layer and comprising a natural emulsifier and a natural protein; And (d) a lactic acid bacterium-containing natural liposome surrounding the second shell layer, the third shell layer comprising a natural cryoprotectant, a method of preparing the same, and a food or pharmaceutical composition comprising the same.본 발명은 (a) 코어로서 유산균; (b) 상기 코어를 둘러싸며, 천연 다당체를 포함하는 제1쉘층; (c) 상기 제1쉘층을 둘러싸며, 천연 유화제 및 천연 단백질을 포함하는 제2쉘층; 및 (d) 상기 제2쉘층을 둘러싸며, 천연 동결보호제를 포함하는 제3쉘층을 포함하는 유산균 함유 천연 리포좀, 그 제조방법 및 이를 포함하는 식품 또는 약학 조성물에 관한 것이다.