Disclosed are methods and compositions for labeling target molecules or associated target molecule tags with origin-specific nucleic acid barcodes. The identity, quantity, and/or activity of target molecules originating from particular discrete volumes, such as droplets, for example water-in-oil emulsions, can be determined by determining the sequence of the origin-specific nucleic acid barcodes (optionally in combination with additional barcodes, such as one or more additional nucleic acid and/or peptide barcode).Linvention concerne des procédés et des compositions pour le marquage de molécules cibles ou des marqueurs de molécules cibles associés comprenant des codes à barres dacides nucléiques spécifiques de lorigine. Lidentité, la quantité et/ou lactivité de molécules cibles provenant de volumes discrets particuliers, tels que des gouttelettes, par exemple des émulsions deau dans lhuile, peuvent être déterminées par détermination de la séquence des codes à barres dacide nucléique spécifiques de lorigine (éventuellement en combinaison avec des codes à barres supplémentaires, tels quun ou plusieurs codes à barres dacide nucléique et/ou de peptide supplémentaires).