The present disclosure is drawn to methods of utilizing nucleic acid barcodes and corresponding amplifying sites in cells in which the barcodes naturally occur. These barcodes and amplifying sites are reconfigured into a single nucleic acid cassette that provides for ease of use in tagging particular species, strains, or variants of cells, each with a different barcode. These barcodes can be used to track the colonization capabilities of the barcoded cells. The present disclosure further provides for assays that utilize natural barcodes to measure relative microbial colonization ability of a plant root system.La présente invention concerne des procédés d'utilisation de codes-barres d'acides nucléiques et de sites d'amplification correspondants dans des cellules dans lesquelles les codes-barres sont naturellement présents. Ces codes-barres et sites d'amplification sont reconfigurés en une seule cassette d'acide nucléique qui offre une facilité d'utilisation dans le marquage d'espèces, de souches ou de variants particuliers de cellules, chacun avec un code-barres différent. Ces codes-barres peuvent être utilisés pour suivre les capacités de colonisation des cellules à codes-barres. La présente invention concerne en outre des dosages qui utilisent des codes-barres naturels pour mesurer la capacité de colonisation microbienne relative d'un système racinaire de plante.
