A method of preparing sol-gel microcapsules loaded with up to 95% (weight / weight) of functional molecules, comprising: a) emulsifying a non-aqueous, water-insoluble solution, comprising sol-gel precursors and functional molecules object of loading, in an aqueous solution, under shear forces and with surfactants; and b) mixing and stirring the emulsion obtained with an acidic, neutral or basic aqueous solution to obtain the micro-capsules loaded in a suspension.Un procedimiento de preparación de microcápsulas de sol-gel cargadas con hasta 95 % (peso/peso) de moléculas funcionales, que comprende: a) emulsionar una solución no acuosa, insoluble en agua, que comprende precursores de sol-gel y las moléculas funcionales objeto de carga, en una solución acuosa, bajo fuerzas de cizalladura y con tensioactivos; y b) mezclar y agitar la emulsión obtenida con una solución acuosa ácida, neutra o básica para obtener las micro-cápsulas cargadas en una suspensión.