The imaging system 101 includes a light source unit that performs illumination with G illumination light, B illumination light, and B ′ illumination light, an imaging unit 12 that captures return light from the subject image at predetermined intervals, and outputs an imaging signal. A pre-processing unit 31 that generates and sequentially outputs the first image signal, the second image signal, and the third image signal for each field, and sequentially outputs the image signal to the first color channel, And a synchronization processing unit 32 that selectively assigns the second color channel and the third color channel. The synchronization processing unit 32 performs first assignment processing for assigning the first to third color channels using the first image signal or the second image signal, and for the first to third color channels. The second assignment process to be assigned using the first image signal or the third image signal is switched.撮像システム１０１は、Ｇ照明光、Ｂ照明光及びＢ’照明光による照明を行う光源部と、被写体像からの戻り光を所定の期間毎に撮像して撮像信号を出力する撮像部１２と、第１の画像信号と、第２の画像信号と、第３の画像信号を１フィールド分ずつ生成して順次出力する前処理部３１と、順次出力される画像信号を、第１の色チャンネル、第２の色チャンネル、及び、第３の色チャンネルに選択的に割り当てる同時化処理部３２とを有する。同時化処理部３２は、第１から第３の色チャンネルに対して第１の画像信号または第２の画像信号を用いて割り当てる第１の割り当て処理と、第１から第３の色チャンネルに対して第１の画像信号または第３の画像信号を用いて割り当てる第２の割り当て処理と、を切り替える。
